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查询Tags标签： KEGG，共有 6条记录-
[GSEAPY] 在Python里进行基因集富集分析
前言 在生物信息学数据分析中，许多分析软件都是基于R开发的。这里介绍一个可以在Python 中进行基因富集分析的Python 软件 GSEAPY (Gene Set Enrichment Analysis in Python)GSEApy is a python wrapper for GESA and Enrichr. It’s used for convenient GO enrichments…
2021/12/27 20:11:35 人评论 次浏览 -
[GSEAPY] 在Python里进行基因集富集分析
前言 在生物信息学数据分析中，许多分析软件都是基于R开发的。这里介绍一个可以在Python 中进行基因富集分析的Python 软件 GSEAPY (Gene Set Enrichment Analysis in Python)GSEApy is a python wrapper for GESA and Enrichr. It’s used for convenient GO enrichments…
2021/12/27 20:11:35 人评论 次浏览 -
KEGG数据库以及 KAAS 网站注释
1. KEGG 现在自己用到的KEGG数据库主要是功能注释，下面谈一下我再用KEGG 时候的经验吧。 首先在kaas上传数据做基因的注释。 我们用的是prokka注释过后的faa文件：是蛋白序列。 当然基因序列也可以。kaas 比对网站https://www.genome.jp/tools/kaas/得到的结果会在kaas的…
2021/10/1 2:11:06 人评论 次浏览 -
KEGG数据库以及 KAAS 网站注释
1. KEGG 现在自己用到的KEGG数据库主要是功能注释，下面谈一下我再用KEGG 时候的经验吧。 首先在kaas上传数据做基因的注释。 我们用的是prokka注释过后的faa文件：是蛋白序列。 当然基因序列也可以。kaas 比对网站https://www.genome.jp/tools/kaas/得到的结果会在kaas的…
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小数据撬动大基金，“黄金”数据库大盘点
不得不感慨，现代信息技术造就的海量数据给了我们许多便利，越来越多的医学研究项目认识到数据的力量，将重心转移到数据上来。已发表数据可以利用起来，做新的分析挖掘，找出事物之间未曾发现的关联；或者整合零散的信息建立新的数据库；或开发新的算法，成为更有力的数据…
2021/5/15 19:27:15 人评论 次浏览 -
小数据撬动大基金，“黄金”数据库大盘点
不得不感慨，现代信息技术造就的海量数据给了我们许多便利，越来越多的医学研究项目认识到数据的力量，将重心转移到数据上来。已发表数据可以利用起来，做新的分析挖掘，找出事物之间未曾发现的关联；或者整合零散的信息建立新的数据库；或开发新的算法，成为更有力的数据…
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