Spark快速上手(4)Spark核心编程-Spark分区器(Partitioner)@(RDD-K_V)
2022/7/5 1:20:19
本文主要是介绍Spark快速上手(4)Spark核心编程-Spark分区器(Partitioner)@(RDD-K_V),对大家解决编程问题具有一定的参考价值,需要的程序猿们随着小编来一起学习吧!
@Spark分区器(Partitioner)
HashPartitioner(默认的分区器)
HashPartitioner分区原理是对于给定的key,计算其hashCode,并除以分区的个数取余,如果余数小于0,则余数+分区的个数,最后返回的值就是这个key所属的分区ID,当key为null值是返回0。
源码在org.apache.spark包下:
origin code:
class HashPartitioner(partitions: Int) extends Partitioner { require(partitions >= 0, s"Number of partitions ($partitions) cannot be negative.") def numPartitions: Int = partitions // 根据键的值来判断在哪一个分区 def getPartition(key: Any): Int = key match { case null => 0 // 键为null始终在0分区 case _ => Utils.nonNegativeMod(key.hashCode, numPartitions) // 键不为0,根据键的hashCode值和分区数进行计算 } override def equals(other: Any): Boolean = other match { case h: HashPartitioner => h.numPartitions == numPartitions case _ => false } ………… } // 底层实质:取模运算 def nonNegativeMod(x: Int, mod: Int): Int = { val rawMod = x % mod rawMod + (if (rawMod < 0) mod else 0) }
RangePartitioner
HashPartitioner分区的实现可能会导致数据倾斜,极端情况下会导致某些分区拥有RDD的所有数据。而RangePartitioner分区器则尽量保证各个分区数据均匀,而且分区和分区之间是有序的,也就是说令一个分区中的元素均比另一个分区中的元素小或者大;但是分区内的元素是不能保证顺序的。简单地说就是将一定范围内的数据映射到一个分区内。
sortByKey底层使用的数据分区器就是RangePartitioner分区器,该分区器的实现方式主要通过两个步骤实现:
①先从整个RDD中抽取样本数据,将样本数据排序,计算出每个分区的最大key值,形成一个Array[key]类型的数组变量rangeBounds;
②判断key在rangeBounds中所处的范围,给出该key值在下一个RDD中的分区id下标。该分区器要求RDD中的key类型必须是可排序的。
origin code:
class RangePartitioner[K : Ordering : ClassTag, V]( partitions: Int, rdd: RDD[_ <: Product2[K, V]], private var ascending: Boolean = true, val samplePointsPerPartitionHint: Int = 20) extends Partitioner { // A constructor declared in order to maintain backward compatibility for Java, when we add the // 4th constructor parameter samplePointsPerPartitionHint. See SPARK-22160. // This is added to make sure from a bytecode point of view, there is still a 3-arg ctor. def this(partitions: Int, rdd: RDD[_ <: Product2[K, V]], ascending: Boolean) = { this(partitions, rdd, ascending, samplePointsPerPartitionHint = 20) } // We allow partitions = 0, which happens when sorting an empty RDD under the default settings. require(partitions >= 0, s"Number of partitions cannot be negative but found $partitions.") require(samplePointsPerPartitionHint > 0, s"Sample points per partition must be greater than 0 but found $samplePointsPerPartitionHint") // 获取RDD中key类型数据的排序器 private var ordering = implicitly[Ordering[K]] // An array of upper bounds for the first (partitions - 1) partitions private var rangeBounds: Array[K] = { if (partitions <= 1) { // 如果给定的分区数是一个的情况下,直接返回一个空的集合,表示数据不进行分区 Array.empty } else { // This is the sample size we need to have roughly balanced output partitions, capped at 1M. // Cast to double to avoid overflowing ints or longs // 给定总的数据抽样大小,最多1M的数据量(10^6),最少20倍的RDD分区数量,也就是每个RDD分区至少抽取20条数据 val sampleSize = math.min(samplePointsPerPartitionHint.toDouble * partitions, 1e6) // Assume the input partitions are roughly balanced and over-sample a little bit. // 计算每个分区抽样的数据量大小,假设输入数据每个分区分布的比较均匀 // 对于超大数据集(分区数量超过5万的)乘以3会让数据稍微增大一点,对于分区数低于5万的数据集,每个分区抽取数据量为60条也不算多 val sampleSizePerPartition = math.ceil(3.0 * sampleSize / rdd.partitions.length).toInt // 从RDD中抽取数据,返回值:(总RDD数据量,Array[分区id, 当前分区的数据量, 当前分区抽取的数据]) val (numItems, sketched) = RangePartitioner.sketch(rdd.map(_._1), sampleSizePerPartition) if (numItems == 0L) { // 如果总的数据量为0(RDD为空),那么直接返回一个空的数组 Array.empty } else { // If a partition contains much more than the average number of items, we re-sample from it // to ensure that enough items are collected from that partition. // 计算总样本数量和总记录数的占比,占比最大为1.0 val fraction = math.min(sampleSize / math.max(numItems, 1L), 1.0) // 保存样本数据的集合buffer val candidates = ArrayBuffer.empty[(K, Float)] // 保存数据分布不均衡的分区id(数据量超过fraction比率的分区) val imbalancedPartitions = mutable.Set.empty[Int] // 计算抽取出来的样本数据 sketched.foreach { case (idx, n, sample) => if (fraction * n > sampleSizePerPartition) { // 如果fraction乘以当前分区中的数据量大于之前计算的每个分区的抽样数据大小,那么表示当前分区抽取的数据太少了,该分区数据分布不均衡,需要重新抽取 imbalancedPartitions += idx } else { // 当前分区不属于数据分布不均衡的分区,计算占比权重,并添加到candidates集合中 // The weight is 1 over the sampling probability. val weight = (n.toDouble / sample.length).toFloat for (key <- sample) { candidates += ((key, weight)) } } } // 对数据分布不均衡的RDD分区,重新进行数据抽样 if (imbalancedPartitions.nonEmpty) { // Re-sample imbalanced partitions with the desired sampling probability. // 获取数据分布不均衡的RDD分区,并构成RDD val imbalanced = new PartitionPruningRDD(rdd.map(_._1), imbalancedPartitions.contains) // 随机种子 val seed = byteswap32(-rdd.id - 1) // 利用RDD的sample抽样函数API进行数据抽样 val reSampled = imbalanced.sample(withReplacement = false, fraction, seed).collect() val weight = (1.0 / fraction).toFloat candidates ++= reSampled.map(x => (x, weight)) } // 将最终的抽样数据计算出rangeBounds RangePartitioner.determineBounds(candidates, math.min(partitions, candidates.size)) } } } // 下一个RDD的分区数量是rangeBounds数组中元素数量+1个 def numPartitions: Int = rangeBounds.length + 1 // 二分查找器,内部使用Java中的Arrays提供的二分查找方法 private var binarySearch: ((Array[K], K) => Int) = CollectionsUtils.makeBinarySearch[K] // 根据RDD的key值返回对应的分区id,从0开始 def getPartition(key: Any): Int = { // 强制转换key类型为RDD中原本的数据类型 val k = key.asInstanceOf[K] var partition = 0 if (rangeBounds.length <= 128) { // If we have less than 128 partitions naive search // 如果分区数据小于等于128个,那么直接本地循环寻找当前k所属的分区下标 while (partition < rangeBounds.length && ordering.gt(k, rangeBounds(partition))) { partition += 1 } } else { // Determine which binary search method to use only once. // 如果分区数量大于128个,那么使用二分查找方法寻找对应k所属的下标 // 但是如果k在rangeBounds中没有出现,实质上返回的是一个负数(范围)或者是一个超过rangeBounds大小的数(最后一个分区,比所有的数据都大) partition = binarySearch(rangeBounds, k) // binarySearch either returns the match location or -[insertion point]-1 if (partition < 0) { partition = -partition-1 } if (partition > rangeBounds.length) { partition = rangeBounds.length } } // 根据数据排序是升序还是降序进行数据的排列,默认为升序 if (ascending) { partition } else { rangeBounds.length - partition } } override def equals(other: Any): Boolean = other match { case r: RangePartitioner[_, _] => r.rangeBounds.sameElements(rangeBounds) && r.ascending == ascending case _ => false } override def hashCode(): Int = { val prime = 31 var result = 1 var i = 0 while (i < rangeBounds.length) { result = prime * result + rangeBounds(i).hashCode i += 1 } result = prime * result + ascending.hashCode result } @throws(classOf[IOException]) private def writeObject(out: ObjectOutputStream): Unit = Utils.tryOrIOException { val sfactory = SparkEnv.get.serializer sfactory match { case js: JavaSerializer => out.defaultWriteObject() case _ => out.writeBoolean(ascending) out.writeObject(ordering) out.writeObject(binarySearch) val ser = sfactory.newInstance() Utils.serializeViaNestedStream(out, ser) { stream => stream.writeObject(scala.reflect.classTag[Array[K]]) stream.writeObject(rangeBounds) } } } @throws(classOf[IOException]) private def readObject(in: ObjectInputStream): Unit = Utils.tryOrIOException { val sfactory = SparkEnv.get.serializer sfactory match { case js: JavaSerializer => in.defaultReadObject() case _ => ascending = in.readBoolean() ordering = in.readObject().asInstanceOf[Ordering[K]] binarySearch = in.readObject().asInstanceOf[(Array[K], K) => Int] val ser = sfactory.newInstance() Utils.deserializeViaNestedStream(in, ser) { ds => implicit val classTag = ds.readObject[ClassTag[Array[K]]]() rangeBounds = ds.readObject[Array[K]]() } } } }
将一定范围内的数映射到某一个分区内,在实现中,分界(rangeBounds)算法用到了水塘抽样算法。RangePartitioner的重点在于构建rangeBounds数组对象,主要步骤是:
- 如果分区数量小于2或者RDD中不存在数据的情况下,直接返回一个空的数组,不需要计算range的边界;如果分区数量大于1的情况下,而且RDD中有数据的情况下,才需要计算数组对象
- 计算总体的数据抽样大小sampleSize,计算规则是:至少每个分区抽取20个数据或者最多1M的数据量
- 根据sampleSize和分区数量计算每个分区的数据抽样样本数量sampleSizePartition
- 调用RangePartitioner的sketch函数进行数据抽样,计算出每个分区的样本
- 计算样本的整体占比以及数据量过多的数据分区,防止数据倾斜
- 对于数据量比较多的RDD分区调用RDD的sample函数API重新进行数据获取
- 将最终的样本数据通过RangePartitioner的determineBounds函数进行数据排序分配,计算出rangeBounds
RangePartitioner的sketch函数的作用是对RDD中的数据按照需要的样本数据量进行数据抽取,主要调用SamplingUtils类的reservoirSampleAndCount方法对每个分区进行数据抽取,抽取后计算出整体所有分区的数据量大小;reserviorSampleAndCount方法的抽取方式是先从迭代器中获取样本数量个数据(顺序获取),然后对剩余的数据进行判断,替换之前的样本数据,最终达到数据抽样的效果。RangePartitioner的determineBounds函数的作用是根据样本数据记忆权重大小确定数据边界。
RangePartitioner的determineBounds函数的作用是根据样本数据记忆权重大小确定数据边界,源代码如下:
origin code:
/** * Determines the bounds for range partitioning from candidates with weights indicating how many * items each represents. Usually this is 1 over the probability used to sample this candidate. * * @param candidates unordered candidates with weights * @param partitions number of partitions * @return selected bounds */ def determineBounds[K : Ordering : ClassTag]( candidates: ArrayBuffer[(K, Float)], partitions: Int): Array[K] = { val ordering = implicitly[Ordering[K]] // 按照数据进行排序,默认升序排序 val ordered = candidates.sortBy(_._1) // 获取总的样本数据大小 val numCandidates = ordered.size // 计算总的权重大小 val sumWeights = ordered.map(_._2.toDouble).sum // 计算步长 val step = sumWeights / partitions var cumWeight = 0.0 var target = step val bounds = ArrayBuffer.empty[K] var i = 0 var j = 0 var previousBound = Option.empty[K] while ((i < numCandidates) && (j < partitions - 1)) { // 获取排序后的第i个数据及权重 val (key, weight) = ordered(i) // 累计权重 cumWeight += weight if (cumWeight >= target) { // Skip duplicate values. // 权重已经达到一个步长的范围,计算出一个分区id的值 if (previousBound.isEmpty || ordering.gt(key, previousBound.get)) {// 上一个边界值为空,或者当前边界值key数据大于上一个边界的值,那么当前key有效,进行计算 // 添加当前key到边界集合中 bounds += key // 累计target步长界限 target += step // 分区数量加1 j += 1 // 上一个边界的值重置为当前边界的值 previousBound = Some(key) } } i += 1 } // 返回结果 bounds.toArray }
自定义分区器
自定义分区器是需要继承org.apache.spark.Partitioner类并实现以下三个方法:
- numPartitioner: Int:返回创建出来的分区数
- getPartition(key: Any): Int:返回给定键的分区编号(0到numPartitions - 1)
- equals():Java判断相等性的标准方法。这个方法的实现非常重要,Spark需要用这个方法来检查你的分区器是否和其他分区器实例相同,这样Spark才可以判断两个RDD的分区方式是否相同
e.g.1
// CustomPartitioner import org.apache.spark.Partitioner /** * @param numPartition 分区数量 */ class CustomPartitioner(numPartition: Int) extends Partitioner{ // 返回分区的总数 override def numPartitions: Int = numPartition // 根据传入的 key 返回分区的索引 override def getPartition(key: Any): Int = { key.toString.toInt % numPartition } } // CustomPartitionerDemo import com.work.util.SparkUtil import org.apache.spark.SparkContext import org.apache.spark.rdd.RDD object CustomPartitionerDemo { def main(args: Array[String]): Unit = { val sc: SparkContext = SparkUtil.getSparkContext() println("=================== 原始数据 =====================") // zipWithIndex 该函数将 RDD 中的元素和这个元素在 RDD 中的 ID(索引号)组合成键值对 val data: RDD[(Int, Long)] = sc.parallelize(0 to 10, 1).zipWithIndex() println(data.collect().toBuffer) println("=================== 分区和数据组合成 Map =====================") val func: (Int, Iterator[(Int, Long)]) => Iterator[String] = (index: Int, iter: Iterator[(Int, Long)]) => { iter.map(x => "[partID:" + index + ", value:" + x + "]") } val array: Array[String] = data.mapPartitionsWithIndex(func).collect() for (i <- array) { println(i) } println("=================== 自定义5个分区和数据组合成 Map =====================") val rdd1: RDD[(Int, Long)] = data.partitionBy(new CustomPartitioner(5)) val array1: Array[String] = rdd1.mapPartitionsWithIndex(func).collect() for (i <- array1) { println(i) } } }
e.g.2
// SubjectPartitioner import org.apache.spark.Partitioner import scala.collection.mutable /** * * @param subjects 学科数组 */ class SubjectPartitioner(subjects: Array[String]) extends Partitioner { // 创建一个 map 集合用来存储到分区号和学科 val subject: mutable.HashMap[String, Int] = new mutable.HashMap[String, Int]() // 定义一个计数器,用来生成自定义分区号 var i = 0 for (s <- subjects) { // 存储学科和分区 subject += (s -> i) // 分区自增 i += 1 } // 获取分区数 override def numPartitions: Int = subjects.size // 获取分区号(如果传入 key 不存在,默认将数据存储到 0 分区) override def getPartition(key: Any): Int = subject.getOrElse(key.toString, 0) } // SubjectPartitionerDemo import java.net.URL import com.work.util.SparkUtil import org.apache.spark.SparkContext import org.apache.spark.rdd.RDD object SubjectPartitionerDemo { def main(args: Array[String]): Unit = { // 获取上下文对象 val sc: SparkContext = SparkUtil.getSparkContext() val tuples: RDD[(String, Int)] = sc.textFile("src/main/data/project.txt").map(line => { val fields: Array[String] = line.split("\t") for (i <- fields) { println(i) } // 取出 url val url: String = fields(1) (url, 1) }) // 将相同的 url 进行聚合,得到了各个学科的访问量 val sumed: RDD[(String, Int)] = tuples.reduceByKey(_ + _).cache() // 从 url 中取出学科的字段,数据组成:学科,url,统计数量 val subjectAndUC: RDD[(String, (String, Int))] = sumed.map(tup => { // 用户 url val url: String = tup._1 // 统计的访问量 val count: Int = tup._2 // 学科 val subject: String = new URL(url).getHost (subject, (url, count)) }) // 将所有学科取出来 val subjects: Array[String] = subjectAndUC.keys.distinct.collect // 创建自定义分区器对象 val partitioner: SubjectPartitioner = new SubjectPartitioner(subjects) // 分区 val partitioned: RDD[(String, (String, Int))] = subjectAndUC.partitionBy(partitioner) // 取 top3 val result: RDD[(String, (String, Int))] = partitioned.mapPartitions(it => { val list: List[(String, (String, Int))] = it.toList val sorted: List[(String, (String, Int))] = list.sortBy(_._2._2).reverse val top3: List[(String, (String, Int))] = sorted.take(3) // 因为方法的返回值需要一个 iterator top3.iterator }) // 存储数据 result.saveAsTextFile("src/main/data/out/") // 释放资源 sc.stop() } }
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