TiKV Raft Store 内存管理的原理与实现丨TiKV 源码解读(二十三)

2024/11/27 21:03:08

本文主要是介绍TiKV Raft Store 内存管理的原理与实现丨TiKV 源码解读(二十三),对大家解决编程问题具有一定的参考价值,需要的程序猿们随着小编来一起学习吧!

导读

内存管理是数据库系统不可忽视的核心问题之一,它直接影响系统的性能、稳定性和成本效率。

良好的内存管理有助于提高资源利用率、降低硬件成本、提升系统可扩展性,从而保障流畅的用户体验; 反之, 如果采取「无为而治」的方式管理内存 ,最终将难逃操作系 统 OOM Killer 的审判 —— 进程被强制终止,服务暂时中断。 在高可用要求的环境下,即使是几秒钟的服务中断也可能造成经济损失。 因此,数据库系统必须具备完善的内存管理机制。

作为知名分布式数据库 TiDB 的基石,TiKV 是一款成熟的分布式存储引擎,对内存管理非常重视。本文作为 TiKV 源码解读系列的续篇,将展开探讨其内存管理机制。本文将重点聚焦于 Raft Store 模块的内存管理。

本文包含以下内容:

  • 概览 TiKV 各模块的内存消耗,建立全局认知;
  • 深入 Raft Store,介绍写请求的处理流程;
  • 讨论处理流程中的内存消耗,并介绍 Raft Store 的内存监控与管理;
  • 具体的源码实现。

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上图展示了 TiKV 的主要模块及其内存消耗来源,解释如下:

  1. Storage :内存用于维护写事务的 Latch 以及 resolved-ts 模块追踪写事务的 Lock。
  2. Coprocessor :内存用于缓存查询中间结果,与 gRPC 响应客户端速度相关,响应缓慢时内存消耗堆积。
  3. Raft Store :内存用于 Raft Messages & Entries & Committed Entries、Entry Cache 和 Region metadata。下文会详细介绍这三大部分。
  4. Raft Engine :基于 Append-only Log 结构,可视为只有 L0 的 LSM-tree,内存用于 Memtable 和 Block Cache,后者默认使用 2% 的系统内存。
  5. KV Engine (RocksDB) :同样存在 LSM-tree 的内存消耗。Block Cache 用于缓存用户数据,默认分配 45% 的系统内存以保障读性能稳定。

在这些模块中,读请求主要在 Coprocessor 和 KV Engine 的 Block Cache 消耗内存,因为无需 Latch 和 Lock,并且可通过 Lease Read 避免走 Raft Store。相比之下,写请求才是 Raft Store 内存消耗的主要来源。因此,接下来我们将重点分析写请求在 Raft Store 的处理流程,以弄清 Raft Store 内存消耗的来源,为后面分析其内存管理机制打下基础。

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在 Raft Store 中,写请求的处理流程相对复杂,不仅涉及 Leader 和 Follower 的不同处理逻辑,还需要经过 Raft 流程的多个阶段。为了提升性能,TiKV 引入了多种优化技术,如 Async 和 Pipeline,这使得流程更加复杂。

我曾尝试用一幅序列图来展示整个写入流程,但最终得到的图片内容要素过多,不便展示。因此我决定将写入流程拆分为三幅图展示。这三幅图分别对应 Leader 和 Follower 处理逻辑的三个阶段 —— PreRaft、Raft 和 Apply 。每个阶段的工作简单概括如下:

  • PreRaft :负责接受,预处理和传递请求/消息给 Raft 系统处理;
  • Raft :负责日志的复制与持久化;
  • Apply :负责将日志应用 到状态机。

写请求的生命周期实际经历了六个步骤:Leader PreRaft -> Leader Raft -> Follower PreRaft -> Follower Raft -> Leader Apply -> Follower Apply。这六个步骤构成一个流水线,实现了时间并行(Temporal Parallelism)。

话不多说,接下来请看三幅图(三个阶段):

前排提醒: 序列图的参与者除明确指出的 Service、Module 和 Thread 外,均为 TiKV 代码中的 struct 实例对象(下同); 序列图刻意忽略了 Raft Batch 处理以简化流程(下同)。

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首先是 PreRaft 阶段的流程,如上图所示,具体解释如下:

  • Leader :gRPC Service 收到写请求后,通过 Storage 模块和 RaftRouter 转发,生成 Raft Command,并通过 channel 将其发送给目标 Region 的 PeerFsm,最终交由 RaftBatchSystem 处理。
  • Leader 或 Followe r:收到 Raft Message 后,经过类似的流程后,将消息交由 RaftBatchSystem 处理。

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特别提醒: 虚线箭头表示异步操作,既可以是直接的异步调用,也可以是由异步事件触发的操作。

其次是 Raft 阶段的流程,如上图所示,具体解释如下:

  • Leader :首先 Raft 线程从 RaftBatchSystem 拉取 PeerFsm 进行处理,向 Raft 模块发起 Propose,得到日志 Entries(未提交的 Entries,区别于下一幅图将介绍的 Committed Entries,)。随后将这些 Entries 异步地发往 Follower。接着将它们缓存到 Entry Cache(下文会详细介绍 Entry Cache),并发起异步地日志持久化操作。最后推进下 Raft 状态。
  • Follower :处理流程与 Leader 类似,但处理的是 Append 而非 Propose。Follower 在处理 Append 请求时会同步更新自己的 Commit Index。此外,Follower 必须同步地持久化日志后,才能响应 Leader 的请求。

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最后是 Apply 阶段的流程,如上图所示,具体解释如下:

  • Leader Follower :Raft 线程收到 Commit 消息后,通过 Raft 模块从 Entry Cache 中拿到 Committed Entries,注册这些 Entries 到 Entry Cache(下文会介绍这一步的用处),并将其发给到 ApplyFsm,最终 ApplyFsm 交由 ApplyBatchSystem 中的 Apply 线程应用到状态机。对于 Leader,在 Apply 完成后,会执行相应的回调函数并通知 Storage 模块写请求处理结束。

相信理解了以上三幅图三个阶段后,脑子里便能串联起写请求生命周期中的六个步骤所做的事情,对 Raft Store 中写请求的处理流程有更多的理解。那么接下来,我们将讨论流程中的内存消耗情况,并介绍 TiKV 如何进行有效的监控和管理。

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内存消耗

首先,我们讨论 Raft Messages、Entries、Committed Entries 的内存消耗。 确切地说,这部分内存消耗还包括 Raft Command。

在上文的写请求处理流程图中,Raft Command,Entries,Committed Entries 都已经出场。Raft Command( https://github.com/tikv/tikv/blob/29e491038704522a0659bddebd86ed1a934bc911/components/raftstore/src/store/msg.rs#L736 ) 是写请求的包装,而 Entries 和 Commited Entries 是未提交和已提交两种形态下的 Entry( https://github.com/tikv/raft-rs/blob/2aefbf627f243dd261b7585ef1250d32efd9dfe7/proto/proto/eraftpb.proto#L23 )。那么 Raft Messages 是什么呢?它涵盖了所有 Region Peer 之间与 Raft 协议相关的所有消息请求( https://github.com/tikv/client-rust/blob/f6774b46a863f012c3a5bb9b1dc5540747082cf2/proto/raft_serverpb.proto#L15 ),支持很多的 MessageType( https://github.com/tikv/raft-rs/blob/2aefbf627f243dd261b7585ef1250d32efd9dfe7/proto/proto/eraftpb.proto#L49 ),然而,在内存管理中我们主要关注 Append Message,因为它会携带 Entries,消耗较多内存。

总的来说,这些对象都是写请求在不同阶段的变体或载体。其形态变化过程可以用下图来表示:

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在单个 TiKV 节点上,这些对象的内存消耗空间复杂度为:

O(num_inflight_requests / request_throughput)

因为内存消耗的增长与并发请求数(num_inflight_requests)成正比,而与请求吞吐量(request_throughput)成反比(处理得越快,内存回收越快)。

假设单个 TiKV 节点能承载 10k 并发写请求,每个请求消耗 10KB 内存,总消耗为 100MB。虽然看似并不大,但这是在正常吞吐量的前提下。如果在写请求某一阶段发生拥塞,导致吞吐量下降。根据上述空间复杂度公式,内存消耗将上升。最常见的情况可能是 RocksDB 触发 Write Stall,导致 Apply 阶段拥塞,进而积压大量 Committed Entries。

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接下来,我们讨论上文写请求处理流程图中的重要参与者 —— Entry Cache。 Entry Cache 的工作可以抽象为上图所示。输入是日志 Entries,缓存后输出用于两个方面:一是为 Apply 阶段提供数据,二是用于 Leader 向慢 Follower 同步日志。

为什么有了 raft-rs 的 Unstable( https://github.com/tikv/raft-rs/blob/2aefbf627f243dd261b7585ef1250d32efd9dfe7/src/log_unstable.rs#L28 )这一 log buffer,还需要 Entry Cache?因为 Unstable 在日志持久化后会清理掉缓存的日志 entries( https://github.com/tikv/raft-rs/blob/2aefbf627f243dd261b7585ef1250d32efd9dfe7/src/raw_node.rs#L601 ),而有时仍需要读取这些 Entries,就不得不穿透到 Raft Engine 进行读取。

为什么有了 raft-rs 的 Unstable(代码定义)这一 log buffer,还需要 Entry Cache? 因为 Unstable 在日志持久化后会清理掉缓存的日志 entries(代码),而有时仍需要读取这些 Entries,就不得不穿透到 Raft Engine 进行读取。 为什么有了 Raft Engine Block Cache,还需要 Entry Cache? 因为 Raft Engine 不是一个 per-region 的存储。在 Raft Engine 中,所有 Region 的日志会都写入同一个文件。因此,同一 Region 的日志可能位于不同的文件 Block 中,批量读取同一个 Region 的日志需要读取多个 Block,空间局部性不好,很可能穿透 Block Cache 引入额外的磁盘 IO。此外,Block Cache 中缓存的是磁盘格式的数据,读取时还需要进行解码,增加了额外的 CPU 开销。

在单个 TiKV 节点上,Entry Cache 的内存消耗空间复杂度为:

O(num_inflight_requests / min{replicate_to_all_throughput, request_throughput} )

replicate_to_all_throughput 是指日志复制(必须持久化)到所有节点的吞吐量。尽管 Follower 上缓存的 entries 在 Apply 阶段完成后可以清理,但 Leader 上缓存的 entries 需要等待所有节点复制完成才能清理(当然失联较久的 Follower 会被忽略)。

之所以使用 min,是因为内存回收速度取决于 replicate_to_all_throughput 和 request_throughput 中较慢的那个。replicate_to_all_throughput 较慢通常出现在慢 Follower 场景,而 request_throughput 较慢则可能发生在 Leader Apply 阶段出现拥塞时,即所有节点已完成日志复制,但请求仍堆积在 Apply 阶段。

最后,我们讨论一下 Region metadata 的内存消耗。 通常认为,Region metadata 是指用于描述一个 Region 的数据结构(如: https://github.com/tikv/client-rust/blob/f6774b46a863f012c3a5bb9b1dc5540747082cf2/proto/metapb.proto#L113 中 Region 的定义)。但在本节中,Region metadata 的定义有所扩展,不仅包括 Region 自身的描述数据,还涵盖与 Region 相关的所有内存数据结构。例如,PeerFsm( https://github.com/tikv/tikv/blob/29e491038704522a0659bddebd86ed1a934bc911/components/raftstore/src/store/fsm/peer.rs#L146 )、ApplyFsm( https://github.com/tikv/tikv/blob/29e491038704522a0659bddebd86ed1a934bc911/components/raftstore-v2/src/fsm/apply.rs#L70 ) 结构体及其字段的内存消耗,尤其是一些用于消息通信的 channel 的内存消耗,PeerFsm 维护的 Raft RawNode( https://github.com/tikv/raft-rs/blob/2aefbf627f243dd261b7585ef1250d32efd9dfe7/src/raw_node.rs#L287 ) 用到的 buffer 的内存消耗等等。这些在上文的写入流程图中大部分已经展示。

在单个 TiKV 节点上,Region metadata 的内存消耗空间复杂度为:

O(memory_cost_per_region * num_regions)

虽然 Region 数量(num_regions)可以根据节点数据量和 Region 大小推算,但由于 channel、buffer 等结构在无负载与有负载情况下的内存消耗差异较大,因此单个 Region 的 metadata 具体内存消耗(memory_cost_pre_region)并不好估算。根据经验,在无负载情况下,单个 Region 的 metadata 内存消耗大约为几十 KB。假设每个 Region 占用 20KB,一个节点存储 4TB 数据,即拥有 40k 个 Region,总内存消耗将达到约 800MB。仅这些静态内存消耗,就已经是不容忽视的开销了。

内存监控

为了及时定位和解决内存异常问题,TiKV 的监控系统覆盖了消耗内存的主要对象,包括 Raft Messages、Entries、Entry Cache 以及 Region metadata 中占大头的 PeerFsm 和 ApplyFsm 等。这些监控项可以帮助运维人员迅速发现问题。在 TiDB Grafana -> TiKV-Details -> Server -> Memory Trace 中,可以直观地查看这些内存消耗数据。监控面板长这个样子:

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内存管理

除了内存监控,TiKV 还实现了多层次的内存管理策略,以应对不同场景下的内存压力。主要分为三种策略:

1. 内存回收(memory compaction

  1. 策略 :在系统内存资源充裕时,TiKV 会自动回收不再使用的内存。
  2. 实现 :正如上文提到的,Raft Message 和 Entries 在完成其生命周期后会立即释放。而对于 Entry Cache 中缓存的 entries,Follower 节点在 Apply 阶段完成后立即释放,而 Leader 节点在 Raft tick 中定期检查并清理那些已成功复制到大多数的 entries。
  3. 目标 :此策 略通过在系统负载较轻时自动释放内存,减少无效占用,从而优化内存利用率。

2. 内存淘汰

  • 当且仅当这些 entries 的日志已经持久化,才允许被清理,以确保在未来需要时能够从磁盘重新加载。
  1. 策略 :当系统内存压力增大,接近高水位线( memory_usage_limit * 0.9 )时,如果此时 Entry Cache 的内存消耗超出阈值( evict_cache_on_memory_ratio ), TiKV 会触发内存淘汰,清理一些未来仍可能会用到的内存对象。
  2. 实现 :内存淘汰检查会在两种情况下触发:一是当 Entry Cache 发生写入时,二是 Raft tick 中定期触发。当确定需要内存淘汰时,会清理部分 Entry Cache entries 和积压在 Apply 阶段的 Committed Entries(两者由 Entry Cache 管理,这就是为什么上文的写入流程图中有一步是将 Committed Entries 注册到 Entry Cache)。
  3. 目标 :此策略通过牺牲部分未来的内存缓存以减少当前的内存消耗,尽管这会增加未来的磁盘 I/O。

3. 拒绝写入

  1. 策略 :当系统内存压力爆表, 超出 高水位线时,如果此时 Entry Cache 和 Raft Message 等对象的内存消耗超出阈值( reject_messages_on_memory_ratio ),TiKV 会拒绝新的写入请求。(这种情况可能发生在因为磁盘故障导致日志无法持久化,Entre Cache 和积压的 Committed Entries 都无法淘汰时。)
  2. 目标 :此策略通过过拒绝部分写入请求,防止系统因 OOM 而终止,降低爆炸半径,为系统自动恢复争取时间。

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在经过上面几节的理论分析后,接下来我们进入源码分析环节(不得不说,这才是源码分析系列文章的核心内容 :)

我们将主要分析一下 Raft Store 内存监控和管理的一些实现。先声明,以下所有的分析都基于 TiKV 最新的 8.3.0 版本,Raft Store v1 版本。

内存监控

内存监控代码的大致实现要点是:

  • 采用一个树状的结构记录各个模块以及其子模块的内存消耗。
  • 监控粒度为节点级别而不是 Region 级别。
  • 在对象创建和销毁的时候分别增加和减少其内存消耗。
  • 周期性地上报监控数据。

对应到具体的代码,树状结构就是 MemoryTrace 。其 trace 字段是父模块的内存消耗值, children 字段持有子模块的指针列表:

pub struct MemoryTrace {
    pub id: Id,
    trace: AtomicUsize,
    children: HashMap<Id, Arc<MemoryTrace>>,
}

通过 mem_trace! 宏定义了 raftstore 模块,以及其子模块 peers(PeerFsm),raft_messages,raft_entreis 等。

pub static ref MEMTRACE_ROOT: Arc<MemoryTrace> = mem_trace!(
    raftstore,
    [
        peers,
        applys,
        entry_cache,
        // ...
        raft_messages,
        raft_entries
    ])

因为监控是节点级别,所以所有 Region 的内存消耗用同一个全局变量记录:

/// Memory usage for raft peers fsms.
pub static ref MEMTRACE_PEERS: Arc<MemoryTrace> =
    MEMTRACE_ROOT.sub_trace(Id::Name("peers"));
/// ...

/// Heap size trace for received Raft Messages.
pub static ref MEMTRACE_RAFT_MESSAGES: Arc<MemoryTrace> =
    MEMTRACE_ROOT.sub_trace(Id::Name("raft_messages"));
/// ...

至于对象内存消耗的增加和减少。我们以 Raft Message 为例。可以看到在 send_raft_message 创建 Raft Message 时,会增加其内存消耗(主要就是 Message 中携带的 Entries):

impl<EK, ER> RaftRouter<EK, ER>
where
    EK: KvEngine,
    ER: RaftEngine,
{
    pub fn send_raft_message(
        &self,
        msg: RaftMessage,
    ) -> std::result::Result<(), TrySendError<RaftMessage>>
        // ...
        let mut heap_size = 0;
        for e in msg.get_message().get_entries() {
            heap_size += bytes_capacity(&e.data) + bytes_capacity(&e.context);
        }
        let event = TraceEvent::Add(heap_size);
        // ...
        MEMTRACE_RAFT_MESSAGES.trace(event);
        defer!(if send_failed.get() {
            MEMTRACE_RAFT_MESSAGES.trace(TraceEvent::Sub(heap_size));
        });
        // ...
    }
}

在 on_raft_message 中 Raft Message 成为 Entries 时,会减去其内存消耗,然后再增加 Entries 的内存消耗:

impl<'a, EK, ER, T: Transport> PeerFsmDelegate<'a, EK, ER, T>
where
    EK: KvEngine,
    ER: RaftEngine,
{
    fn on_raft_message(&mut self, m: Box<InspectedRaftMessage>) -> Result<()> {
        // ...
        defer!({
            // ...
            MEMTRACE_RAFT_MESSAGES.trace(TraceEvent::Sub(heap_size));
            if stepped.get() {
                unsafe {
                    // It could be less than exact for entry overwriting.
                    *memtrace_raft_Entries += heap_size;
                    MEMTRACE_RAFT_Entries.trace(TraceEvent::Add(heap_size));
                }
            }
        });
        // ...
}

其余的 Entry Cache、Committed Entries 等对象的处理逻辑类似。

至于 Region Metadata, 目前主要监控了一些消耗占大头的数据结构,具体可参考: PeerFsm::update_memory_trace 和 ApplyFsm::update_memory_trace 。

最后,可以再看一下 TiKVServer::init_metrics_flusher 。这里设定了监控上报的周期 DEFAULT_MEMTRACE_FLUSH_INTERVAL 。

self.core.background_worker.spawn_interval_task(
    DEFAULT_MEMTRACE_FLUSH_INTERVAL,
    move || {
        let now = Instant::now();
        mem_trace_metrics.flush(now);
    },
);

这个周期默认是 1s。换句话说,一些生命周期短的对象(如 Raft Message 和 Entries)有可能在监控中看不到,因为通常它们「来也匆匆,去也匆匆」。

内存管理

接下来,我们将依次介绍 EntryCache 的读取、写入、内存回收,内存淘汰以及 TiKV 在内存压力爆表时拒绝写入等逻辑。

Entry Cache 的读取调用链为 PeerStorage::entries -> EntryStorage::entries -> EntryCache::fetch_entries_to 。

若还想要追溯到 PeerStorage 的上一层,IDE 可能无能为力,因为更上一层位于另 一个 repo —— raft-rs。raft-rs 在许多地方采用了 「Don’t call me, I’ll call you」 的设计 。作为一个库,有时不让 TiKV 调用它,而是反过来调用 TiKV。它持有 TiKV 的存储数据结构 PeerStorage,并在合适的时机调用 PeerStorage 的方法读取 Entries。这发生在 RaftLog::slice 中:

impl<T: Storage> RaftLog<T> {
    /// ...
    /// Grabs a slice of entries from the raft. Unlike a rust slice pointer, these are
    /// returned by value. The result is truncated to the max_size in bytes.
    pub fn slice(
        &self,
        low: u64,
        high: u64,
        max_size: impl Into<Option<u64>>,
        context: GetEntriesContext,
    ) -> Result<Vec<Entry>> {
        // ...
        if low < self.unstable.offset {
            // ...
            match self.store.entries(low, unstable_high, max_size, context)
        }
        // ...
    }
    // ...
}

Entry Cache 的写入调用链为 PeerFsm::handle_normal -> PeerFsmDelegate::collect_ready -> Peer::handle_raft_ready_append -> PeerStorage::handle_raft_ready -> EntryStorage::append -> EntryCache::append 。

Entry Cache 的内存回收逻辑位于 EntryStorage::compact_entry_cache 。Follower 在 Apply 阶段结束后调用它,参见 Peer::post_apply ;Leader 在日志复制到所有节点后调用,参见 PeerFsmDelegate::on_raft_gc_log_tick 。

Entry Cache 的内存淘汰判定逻辑位于 needs_evict_entry_cache ,触发于 PeerFsmDelegate::on_raft_log_gc_tick 或 Peer::handle_raft_committed_entries 。在 EntryCache::compact_to 中,会同时清理已持久化的 Entry Cache entries 和 Committed Entries(注册在 EntryCache::trace 中)。清理 Committed Entries 时需谨慎处理,因为 Leader 支持异步持久化日志,未持久化的 Committed Entries 不能清理。主要代码如下:

pub fn compact_to(&mut self, mut idx: u64) -> u64 {
    if idx > self.persisted + 1 {
        // Only the persisted entries can be compacted
        idx = self.persisted + 1;
    }
    // ...
    while let Some(cached_entries) = self.trace.pop_front() {
        // Do not evict cached entries if not all of them are persisted.
        // After PR #16626, it is possible that applying entries are not
        // yet fully persisted. Therefore, it should not free these
        // entries until they are completely persisted.
        if cached_entries.range.start >= idx || cached_entries.range.end > self.persisted + 1 {
            self.trace.push_front(cached_entries);
            let trace_len = self.trace.len();
            let trace_cap = self.trace.capacity();
            if trace_len < SHRINK_CACHE_CAPACITY && trace_cap > SHRINK_CACHE_CAPACITY {
                self.trace.shrink_to(SHRINK_CACHE_CAPACITY);
            }
            break;
        }
        let (_, dangle_size) = cached_entries.take_entries();
        // ...
        idx = cmp::max(cached_entries.range.end, idx);
    }
    // ...

    let cache_first_idx = self.first_index().unwrap_or(u64::MAX);
    // ...

    let cache_last_idx = self.cache.back().unwrap().get_index();
    // Use `cache_last_idx + 1` to make sure cache can be cleared completely if
    // necessary.
    let compact_to = (cmp::min(cache_last_idx + 1, idx) - cache_first_idx) as usize;
    for e in self.cache.drain(..compact_to) {
        // ...
    }
    // ...
}

最后,拒绝写入的逻辑可以参考 needs_reject_raft_append 。

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本文首先概述了 TiKV 各模块的内存消耗情况,随后通过写请求的处理流程,分析了 Raft Store 中内存消耗的三大主要来源,并探讨了相关的内存监控与管理机制,最后简要浏览了一些源码。希望本文能帮助读者更好地了解 TiKV 实现内存可控和服务持续可用的原理,实现分布式系统的合理设计和高效运维。



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