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查询Tags标签： Home，共有 1480条记录-
linux 中 sed = 选项在每一行之前插入编号
001、(base) [email protected]:/home/test4# ls a.txt (base) [email protected]:/home/test4# cat a.txt ## 测试数据 This is 1 This is 2 This is 3 This is 4 This is 5 (base) [email protected]:/home/test4# sed = a.txt ## 在每一行之前插入编号 1 T…
2022/8/17 5:22:45 人评论 次浏览 -
linux中sed命令删除匹配特定字符之间的数据
001、(base) [email protected]:/home/test2# ls a.txt (base) [email protected]:/home/test2# cat a.txt ## 测试数据 01 02 AAA 03 04 05 BBB 06 07 08 CCC 09 10 (base) [email protected]:/home/test2# sed /AAA/,/BBB/d a.txt ## 删除匹配…
2022/8/17 5:22:44 人评论 次浏览 -
linux 中sed命令的保护模式b选项
001、(base) [email protected]:/home/test2# cat a.txt ## 测试数据 1 2 3 k 4 5 6 7 k 8 9 10 (base) [email protected]:/home/test2# sed /k/{n;d} a.txt ## 删除匹配k之后的一行 1 2 3 k 5 6 7 k 9 10 (base) [email protected]:/home/tes…
2022/8/17 5:22:43 人评论 次浏览 -
python中统计人类基因组的外显子总长度（部分测试序列）
001、方法1[email protected]:/home/test# ls a.txt test.py [email protected]:/home/test# cat a.txt ## 测试数据 #chromosome nc_accession gene gene_id ccds_id ccds_status cds_strand cds_from …
2022/8/17 1:53:20 人评论 次浏览 -
python 中实现按照 fasta文件的scaffold进行排序
001、 方法1[email protected]:/home/test# ls a.fasta test.py [email protected]:/home/test# cat test.py ## 测试程序 #!/usr/bin/python in_file = open("a.fasta", "r") dict1 = dict()for i in in_file:i = i.strip()i…
2022/8/16 14:55:45 人评论 次浏览 -
centos7根分区扩容(减少home分区容量)
由于安装centos时没有手动分区，导致/home分区过大。而在工作中基本使用docker来安装一些软件 而安装docker的默认存储是在/var/lib/docker 时间长了，程序占用空间就大了。 这个时候根分区就不够用了。 临时解决: 1. lvreduce -L 100G /dev/mapper/centos-home (减…
2022/8/16 5:23:02 人评论 次浏览 -
python 中实现切除fastq文件序列的前后若干碱基
001、[email protected]:/home/test# ls a.fastq test.py [email protected]:/home/test# cat test.py ## 测试程序 #!/usr/bin/python in_file = open("a.fastq", "r") out_file = open("result.txt", "w") di…
2022/8/16 1:23:47 人评论 次浏览 -
python 中统计fastq文件中 GC含量
001、[email protected]:/home/test# ls a.fastq test.py [email protected]:/home/test# cat a.fastq ## 测试fastq文件 @DJB775P1:248:D0MDGACXX:7:1202:12362:49613 TGCTTACTCTGCGTTGATACCACTGCTTAGATCGGAAGAGCACACGTCTGAA + JJJJJIIJJJJJJH…
2022/8/16 1:23:26 人评论 次浏览 -
python中提取原始序列名字第一个空格前的名字作为的序列名字，输出到屏幕
001、(base) [email protected]:/home/test2# ls a.fasta test.py (base) [email protected]:/home/test2# cat a.fasta ## 测试fasta文件 >gene1 myc AGCTGCCTAAGC GGCATAGCTAATCG >gene2 jun ACCGAATCGGAGCGATG GGCATTAAAGATCTAGCT >gene3 malat1 A…
2022/8/14 14:54:14 人评论 次浏览 -
linux部署jar包脚本和注册开机启动
前言 之前开发了windows部署jar包为服务的工具在实际生产环境中使用非常简单方便，公司部分项目是部署在linux系统中的，所以决定整合一个通用的jar包部署脚本，并注册为开机启动服务，为开发实施的同事提供方便，以下操作实际系统环境为centos8 通过脚本启动安装jdk，可以…
2022/8/14 5:24:39 人评论 次浏览 -
python中实现依据序列名称排序并输出
001、(base) [email protected]:/home/test2# ls a.fasta test.py (base) [email protected]:/home/test2# cat a.fasta ## 测试fasta文件 >gene2 myc AGCTGCCTAAGC GGCATAGCTAATCG >gene1 jun ACCGAATCGGAGCGATG GGCATTAAAGATCTAGCT >gene4 …
2022/8/14 1:53:56 人评论 次浏览 -
Ubuntu快速搭建单步调试openjdk环境
版本操作系统 Ubuntu 20.04.2 LTS编译的jdk jdk8boot jdk jdk7看源码的工具 Clion安装引导 JDK。 所有 OpenJDK 构建都需要访问以前发布的 JDK，称为引导 JDK。 一般规则是引导 JDK 必须是 JDK 先前主要版本的实例。 比如，构建JDK 8需要使用更新为7或更高版本的JDK 7版本…
2022/8/13 5:23:32 人评论 次浏览 -
linux find命令详解
Linux中find常见用法示例 find path -option [ -print ] [ -exec -ok command ] {} \;find命令的参数； pathname: find命令所查找的目录路径。例如用.来表示当前目录，用/来表示系统根目录。-print： find命令将匹配的文件输出到标准输出。-exec： find命…
2022/8/13 5:23:00 人评论 次浏览 -
ubuntu 下 安装 anaconda3 以及使用
一、安装 参考资料： https://blog.csdn.net/weixin_49223002/article/details/123031334 Ubuntu安装anaconda3 https://blog.csdn.net/anniaxie/article/details/107198266 ubuntu16.04下Anaconda3的使用二、使用 1，添加环境变量 在~/.bashrc中添加export PATH="…
2022/8/12 5:24:50 人评论 次浏览 -
linux安装jdk1.8
一，安装前的清理工作 rpm -qa | grep jdkrpm -qa | grep gcjyum -y remove java-xxx-xxx 二 ， 在线下载JDK 命令：wget --no-check-certificate --no-cookies --header "Cookie: oraclelicense=accept-securebackup-cookie" http://download.oracle.com/otn-p…
2022/8/12 5:24:35 人评论 次浏览
