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查询Tags标签： 基因，共有 25条记录-
GEO代码分析流程 - 4. 差异分析 - 数据
4. 差异分析 - 数据rm(list = ls()) load(file = "step2output.Rdata")#差异分析，用limma包来做 #需要表达矩阵（exp）和分组信息（group_list），不需要改 library(limma) design=model.matrix(~group_list) #分组信息为二分类。 fit=lmFit(exp…
2022/9/10 6:24:35 人评论 次浏览 -
【动植物研究动态】20220828文献解读
目录Science Bulletin | 中国农科院作科所徐建龙&邱丽娟：大豆种质资源组学数据库SoyFGBv2.0搭建SCLS | 种康、贾继增等： 中国小麦基因组学和性状改良研究综述The Crop Journal | 中国农科院作科所：小麦穗数智能识别模型并验证其遗传应用价值Genome Research丨华中农…
2022/8/28 23:25:23 人评论 次浏览 -
【动植物研究动态】20220815文献解读
目录Hortic Res | 武汉大学李家儒：盾叶薯蓣高质量基因组解析与薯蓣皂苷生物合成进化The Crop Journal | 华南农业大学肖德琴：一种新的水稻穗多发育期自动识别算法The Crop Journal | 华南农业大学植物航天育种工程技术研究中心定位到正向调控水稻粒长QTLBMC Plant Biolo…
2022/8/28 23:25:19 人评论 次浏览 -
【动植物研究动态】20220722文献解读
目录Science | 农科院作科所周文彬：水稻中转录因子OsDREB1C同时提高光合作用效率和氮素利用效率MP | 中国科学院昆明植物研究所吴建强：列当科植物的比较基因组学分析揭示了寄生植物的演化历史Nature Plants | 农科院作科所王天宇：现代玉米杂种优势群遗传改良与分化的基…
2022/7/23 6:24:13 人评论 次浏览 -
【动植物研究动态】20220626文献解读
目录PBJ | 中国农业科学院棉花研究所揭示表达新等位基因动态调控棉花纤维长度的分子机理Molecular Plant | 北京大学现代农业研究院张兴平：发表首个西瓜T2T基因组Plant Com | 江苏省农科院：找回棉花“丢失”的优质纤维和抗旱关键基因Mol Plant | 中国农科院基因组所：解…
2022/6/27 6:23:46 人评论 次浏览 -
python中 从gff文件提取指定基因信息
1、测试数据下载：ftp://ftp.ensemblgenomes.org/pub/plants/release-44/gff3/arabidopsis_thaliana/Arabidopsis_thaliana.TAIR10.44.chromosome.1.gff3.gz 2、[root@PC1 test2]# ls Arabidopsis_thaliana.TAIR10.44.chromosome.1.gff3.gz [root@PC1 test2]# gunzip Arab…
2022/6/8 1:20:12 人评论 次浏览 -
R语言零基础基因/数据差异分析（一）
R语言零基础基因/数据差异分析（一） 文章目录介绍环境搭建软件下载结果展示基因数据下载流程基因数据处理利用GEO分析绘制拟火山图 注意，本 系列 有连贯性，每一步都很详细，每一步都很重要，请耐心读完！！介绍 本系列文主要依据真实论文制图流程，详细说明制图过程，…
2022/3/6 6:17:57 人评论 次浏览 -
向受体细胞导入 DNA 的方法
转化 Transformation: 是指含外源基因的重组质粒（载体）将外源基因直接导入细菌、和非动物的真核细胞的方法，使之获得新的遗传特性。 转染 Transfection: 是指重组质粒载体或游离核苷酸在脂质体等介导下进入真核细胞。 转导 Transduction: 是指通过重组病毒载体将外源基…
2022/3/1 6:23:18 人评论 次浏览 -
Python 运筹优化9 再次拆解基本的遗传算法
说明爹有娘有，不如自个有成熟的包稍微参考一下，或者在某些场景下对付一下即可。核心的部件还是要自己研发。本篇从0.1开始（因为以前已经写过一篇)，构造一个新的可迭代版本。 目标： 1 完成连通性测试。2 可以使用GPU运算。3 厘清算法的要素和要点。4 使用PM规范搭建（…
2021/12/19 1:19:36 人评论 次浏览 -
Python 运筹优化9 再次拆解基本的遗传算法
说明爹有娘有，不如自个有成熟的包稍微参考一下，或者在某些场景下对付一下即可。核心的部件还是要自己研发。本篇从0.1开始（因为以前已经写过一篇)，构造一个新的可迭代版本。 目标： 1 完成连通性测试。2 可以使用GPU运算。3 厘清算法的要素和要点。4 使用PM规范搭建（…
2021/12/19 1:19:36 人评论 次浏览 -
文献(5): 单细胞转录组揭示人类纤维化皮肤病中成纤维细胞的异质性
一句话评价：小样本量单细胞转录组在冷门疾病领域应用前景尚可，常规套路也能发NC1. Title标题可以看出本研究的主要内容：①构建成纤维细胞的图谱/揭示成纤维细胞的异质性；②找到一群（相对于正常样本）在纤维化皮肤病中含量升高的间充质成纤维细胞 2. Background纤维化…
2021/10/23 6:10:07 人评论 次浏览 -
文献(5): 单细胞转录组揭示人类纤维化皮肤病中成纤维细胞的异质性
一句话评价：小样本量单细胞转录组在冷门疾病领域应用前景尚可，常规套路也能发NC1. Title标题可以看出本研究的主要内容：①构建成纤维细胞的图谱/揭示成纤维细胞的异质性；②找到一群（相对于正常样本）在纤维化皮肤病中含量升高的间充质成纤维细胞 2. Background纤维化…
2021/10/23 6:10:07 人评论 次浏览 -
利用遗传学算法求解工作分配问题
问题：现在有10份工作。有300名工人被分配参与这10份工作，每份工作需要30人。每人参与不同的工作都有个评价值，代表该人参与该工作的损耗值，损耗值的范围在0-9。问：如何分配这300人工作，使得总的损耗值最低。本问题的基础数据： 工人选择工作损耗表数据.rar这是一个典…
2021/7/24 12:16:26 人评论 次浏览 -
利用遗传学算法求解工作分配问题
问题：现在有10份工作。有300名工人被分配参与这10份工作，每份工作需要30人。每人参与不同的工作都有个评价值，代表该人参与该工作的损耗值，损耗值的范围在0-9。问：如何分配这300人工作，使得总的损耗值最低。本问题的基础数据： 工人选择工作损耗表数据.rar这是一个典…
2021/7/24 12:16:26 人评论 次浏览 -
教遗传算法人工智能玩超级马里奥大陆
这是教授 AI 为 GameBoy 玩超级马里奥乐园系列的第一篇文章，在这里我将向您展示如何开发遗传算法 AI 以使用 Python 玩超级马里奥乐园。 （完整代码在我的 GitHub 链接在文末） 《超级马里奥大陆》是任天堂开发的一款平台游戏，它讲述了一个勇敢的水管工马里奥拯救公主的…
2021/7/14 9:05:04 人评论 次浏览
