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查询Tags标签: 富集,共有 6条记录
  • [GSEAPY] 在Python里进行基因集富集分析

    前言 在生物信息学数据分析中,许多分析软件都是基于R开发的。这里介绍一个可以在Python 中进行基因富集分析的Python 软件 GSEAPY (Gene Set Enrichment Analysis in Python)GSEApy is a python wrapper for GESA and Enrichr. It’s used for convenient GO enrichments…

    2021/12/27 20:11:35 人评论 次浏览
  • [GSEAPY] 在Python里进行基因集富集分析

    前言 在生物信息学数据分析中,许多分析软件都是基于R开发的。这里介绍一个可以在Python 中进行基因富集分析的Python 软件 GSEAPY (Gene Set Enrichment Analysis in Python)GSEApy is a python wrapper for GESA and Enrichr. It’s used for convenient GO enrichments…

    2021/12/27 20:11:35 人评论 次浏览
  • 富集分析的原理与实现

    一般做完差异分析都会做这一步,目的是找到差异基因富集到的通路,进而与生物学意义联系起来。具体的统计方法很简单,这篇笔记里面的代码可以从零搭建一个富集分析工具。后台回复20211007获取本文的测试数据和代码,以及(单细胞)转录组分析中可能用到的GO KEGG富集分析…

    2021/10/29 6:09:44 人评论 次浏览
  • 富集分析的原理与实现

    一般做完差异分析都会做这一步,目的是找到差异基因富集到的通路,进而与生物学意义联系起来。具体的统计方法很简单,这篇笔记里面的代码可以从零搭建一个富集分析工具。后台回复20211007获取本文的测试数据和代码,以及(单细胞)转录组分析中可能用到的GO KEGG富集分析…

    2021/10/29 6:09:44 人评论 次浏览
  • 批量富集分析气泡图的画法

    目录 前言 一、compareCluster函数 二、使用步骤 1.加载包 2.读入数据 3.处理数据数据4.ID转换 5.通路富集 6.可视化 总结前言clusterProfile是常用的基因富集分析的包,之前已经介绍过了对但样本集合进行富集分析的操作。本次我们尝试一下使用包中的compareCluster函数对…

    2021/9/22 23:13:54 人评论 次浏览
  • 批量富集分析气泡图的画法

    目录 前言 一、compareCluster函数 二、使用步骤 1.加载包 2.读入数据 3.处理数据数据4.ID转换 5.通路富集 6.可视化 总结前言clusterProfile是常用的基因富集分析的包,之前已经介绍过了对但样本集合进行富集分析的操作。本次我们尝试一下使用包中的compareCluster函数对…

    2021/9/22 23:13:54 人评论 次浏览
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