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查询Tags标签： bed，共有 3条记录-
第一题
# 窗口拆分 test.bed 需要修改bedtools makewindows -g test.bed -w 100000 -s 100000 >> 100k_window.bed# tumor coverage countbedtools coverage -a 100k_window.bed -b tumor.bam > tumor.counts.txt# normal coverage countbedtools coverage -a 100k_…
2022/9/7 23:22:57 人评论 次浏览 -
linux shell实现 GWAS显著性区域的合并
001、root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test5# ls record.sh region.bed root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test5# wc -l region.bed ## 测试数据 1058 region.bed root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test5# head -n 5 region.bed ## 测试数据 Chr1 1560051 1570051 3.6112E-10…
2022/7/21 5:26:09 人评论 次浏览 -
复杂又高效的SQL
update hd_mach_usage_rec djoin ( select us.id,us.turn_off_time,us.hd_mach_id,us.fk_bed_area_id,us.fk_bed_id ,md.in_end_time,md.fk_dr_id,dr.end_time from hd_mach_usage_rec us inner JOIN (SELECT fk_dr_id,hd_mach_id,…
2022/3/29 19:26:41 人评论 次浏览
