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查询Tags标签: bwa,共有 4条记录-
bwa软件对参考基因组构建索引文件
1、当参考基因组 大于2G时(约20亿个核苷酸,20,0000,0000):bwa index -a bwtsw xxx.fa 小于2G时(约20亿个核苷酸,20,0000,0000):bwa index xxx.fa2、统计参考基因组碱基数目root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test# ls Arabidopsis_thaliana.TAIR10.dna.toplevel.fa roo…
2022/4/28 6:14:21 人评论 次浏览 -
pintools的简单使用
目录 一、利用pintools分析bwa程序 (1)分析函数的调用次数,给出函数调用次序的排序 1. 将写好的插桩程序进行make ,参考Intel官网步骤 2. 下载bwa程序 3. 利用写好的pintools插桩程序来分析bwa的函数调用次数。 (2)分析函数的执行时间,按照执行时间排序。 1. 问题二…
2021/7/19 6:09:14 人评论 次浏览 -
pintools的简单使用
目录 一、利用pintools分析bwa程序 (1)分析函数的调用次数,给出函数调用次序的排序 1. 将写好的插桩程序进行make ,参考Intel官网步骤 2. 下载bwa程序 3. 利用写好的pintools插桩程序来分析bwa的函数调用次数。 (2)分析函数的执行时间,按照执行时间排序。 1. 问题二…
2021/7/19 6:09:14 人评论 次浏览 -
实验记录 | 6/1
(1)首先,下载完成annovar配套的数据库。 perl annotate_variation.pl -buildver hg19 -downdb -webfrom annovar ljb26_all humandb/(base) zxx@zxx-Lenovo-Yoga710-14ISK:/media/zxx/TOSHIBA/QBRC/annovar$ perl annotate_variation.pl -buildver hg19 -downdb -webfr…
2021/6/2 10:26:04 人评论 次浏览