用Python实现全局比对中的Needleman Wunsch方法

2021/7/26 17:09:19

本文主要是介绍用Python实现全局比对中的Needleman Wunsch方法,对大家解决编程问题具有一定的参考价值,需要的程序猿们随着小编来一起学习吧!

基于知乎用户@我不是大熊的代码进行了类的封装。增加了不同的罚分选项,提高易用性。

Python没有原生的Matrix,因此需要内置的嵌套结构来完成,比较麻烦。

代码如下:

https://github.com/BatheFu/bio_learn

 

参考链接:

https://zhuanlan.zhihu.com/p/78027062



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