Python读取大文件的"坑“与内存占用检测

2021/12/12 7:20:19

本文主要是介绍Python读取大文件的"坑“与内存占用检测,对大家解决编程问题具有一定的参考价值,需要的程序猿们随着小编来一起学习吧!

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python读写文件的api都很简单,一不留神就容易踩”坑“。笔者记录一次踩坑历程,并且给了一些总结,希望到大家在使用python的过程之中,能够避免一些可能产生隐患的代码。

1.read()与readlines()
随手搜索python读写文件的教程,很经常看到read()与readlines()这对函数。所以我们会常常看到如下代码:

with open(file_path, 'rb') as f:
sha1Obj.update(f.read())
or
with open(file_path, 'rb') as f:
for line in f.readlines():
print(line)
  

这对方法在读取小文件时确实不会产生什么异常,但是一旦读取大文件,很容易会产生MemoryError,也就是内存溢出的问题。

 

####Why Memory Error?

我们首先来看看这两个方法:

 

当默认参数size=-1时,read方法会读取直到EOF,当文件大小大于可用内存时,自然会发生内存溢出的错误。

read方法
read([size])方法从文件当前位置起读取size个字节,若无参数size,则表示读取至文件结束为止,它范围为字符串对象

 

同样的,readlines会构造一个list。list而不是iter,所以所有的内容都会保存在内存之上,同样也会发生内存溢出的错误。

readlines方法
该方法每次读出一行内容,所以,读取时占用内存小,比较适合大文件,该方法返回一个字符串对象。

 

2.正确的用法
在实际运行的系统之中如果写出上述代码是十分危险的,这种”坑“十分隐蔽。所以接下来我们来了解一下正确用,正确的用法也很简单,依照API之中对函数的描述来进行对应的编码就OK了:

如果是二进制文件推荐用如下这种写法,可以自己指定缓冲区有多少byte。显然缓冲区越大,读取速度越快。

with open(file_path, 'rb') as f:
while True:
buf = f.read(1024)
if buf:
sha1Obj.update(buf)
else:
break
  而如果是文本文件,则可以用readline方法或直接迭代文件(python这里封装了一个语法糖,二者的内生逻辑一致,不过显然迭代文件的写法更pythonic )每次读取一行,效率是比较低的。笔者简单测试了一下,在3G文件之下,大概性能和前者差了20%.

with open(file_path, 'rb') as f:
while True:
line = f.readline()
if buf:
print(line)
else:
break
with open(file_path, 'rb') as f:
for line in f:
print(line)
  

3.内存检测工具的介绍
对于python代码的内存占用问题,对于代码进行内存监控十分必要。这里笔者这里推荐两个小工具来检测python代码的内存占用。

 

####memory_profiler

首先先用pip安装memory_profiler

pip install memory_profiler
  

from hashlib import sha1
import sys
@profile
def my_func():
sha1Obj = sha1()
with open(sys.argv[1], 'rb') as f:
while True:
buf = f.read(10 * 1024 * 1024)
if buf:
sha1Obj.update(buf)
else:
break
print(sha1Obj.hexdigest())
if __name__ == '__main__':
my_func()
  

之后在运行代码时加上** -m memory_profiler**

就可以了解函数每一步代码的内存占用了

guppy
依样画葫芦,仍然是通过pip先安装guppy

pip install guppy
  之后可以在代码之中利用guppy直接打印出对应各种python类型(list、tuple、dict等)分别创建了多少对象,占用了多少内存。
from guppy import hpy
import sys
def my_func():
mem = hpy()
with open(sys.argv[1], 'rb') as f:
while True:
buf = f.read(10 * 1024 * 1024)
if buf:
print(mem.heap())
else:
break
  

 



这篇关于Python读取大文件的"坑“与内存占用检测的文章就介绍到这儿,希望我们推荐的文章对大家有所帮助,也希望大家多多支持为之网!


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