Biopython测试技术

Biopython具有广泛的测试脚本,可以在不同条件下对软件进行测试,以确保软件没有错误。要运行测试脚本,请下载Biopython的源代码,然后运行以下命令-

python run_tests.py

这将运行所有测试脚本,并产生以下输出-

Python version: 2.7.12 (v2.7.12:d33e0cf91556, Jun 26 2016, 12:10:39) 
[GCC 4.2.1 (Apple Inc. build 5666) (dot 3)] 
Operating system: posix darwin 
test_Ace ... ok 
test_Affy ... ok 
test_AlignIO ... ok 
test_AlignIO_ClustalIO ... ok 
test_AlignIO_EmbossIO ... ok 
test_AlignIO_FastaIO ... ok 
test_AlignIO_MauveIO ... ok 
test_AlignIO_PhylipIO ... ok 
test_AlignIO_convert ... ok 
........................................... 
...........................................

还可以按照下面的指定运行单独的测试脚本-

python test_AlignIO.py

结论
据了解,Biopython是生物信息学领域的重要软件之一。用python编写(易于学习和编写),它提供了广泛的功能来处理生物信息学领域中的任何计算和操作。它还为几乎所有流行的生物信息学软件提供了简便灵活的界面,也可以利用其功能。


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